La série suit les événements qui se déroulent dans une prison de haute sécurité « alternative », mettant en scène « Warden » le directeur de la prison, narcissique et infantile, il met en danger régulièrement la vie des prisonniers pour satisfaire ses propres caprices; « Alice » gardienne en chef stéroïdée; « Jailbot » le robot à-tout-faire de la prison et « Jared » le comptable et assistant principal du directeur, il gère la plupart des tâches administratives de la prison, perpétuellement paniqué par les événements en cours. Superjail! se caractérise par une violence extrême désamorcée par un traitement psychédélique du graphisme et par son humour noir. Le contenu de ce programme a été jugé inapproprié pour un public âgé de moins de 17 ans aux Etats-Unis. La majorité des épisodes de Superjail! se déroulent à l'intérieur de la prison du même nom. La prison est bâtie à l'intérieur d'un volcan qui est lui-même situé dans un volcan plus grand. Dans la première saison, chaque épisode commence avec une histoire tournant autour d'une idée saugrenue du directeur de la prison et s’achève par un bain de sang psychédélique au cours duquel des dizaines de détenus s’entretuent ou sont assassinés par une entité extérieure à la prison. Certains épisodes n'ont pas de résolution finale, et l'histoire peut tout simplement s'arrêter lorsque les événements ont atteint leur paroxysme. La situation de départ est néanmoins restaurée à chaque épisode.